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Première Rencontre de la Société Marocaine de Classification
23-25 mars 2017 Tangier (Maroc)
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Conférences Plénières
Conférencier 1
Judit Kumuthini Centre de recherche en Génomique et Protéomique Cape Town-Afrique du Sud
Standardisation des Données Omics Résumé: La technologie DMET (Distribution, Métabolisme, Excrétion et Toxicité) n'a cessé de progresser et conduit à une demande accrue pour développer de nouveaux logiciels de bioinformatique, des outils d'analyse, des algorithmes, des applications web et des techniques statistiques spécifiques. Avec l'avènement de la médecine personnalisée, il est évident qu'un grand nombre d'études pilotes seront menées à l'échelle mondiale dans un avenir prévisible. Les résultats entre les différentes études peuvent être comparées efficacement si les standards de rapports données sont en place. En outre, si les données sont extraites d'une manière concise et correcte, ils peuvent être utilisés dans des expériences ultérieures. Nous estimons que la qualité des données remplace la quantité et en utilisant une méthode concise de l'extraction de données à partir de réseaux DMET, on peut augmenter considérablement la capacité de l'expérimentateur pour trier l'information biologiquement significative du bruit de fond et de l'erreur expérimentale. En fin de compte, le domaine de la pharmacogénomique va évoluer pour intégrer des données provenant de diverses plates-formes omique et technologiques. La mise en œuvre des normes pour la présentation des données pour chacune des différentes plates-formes (microarrays, tableaux SNP, protéomique et DMET), aidera le développement de pipelines capables de consolider les différentes plates-formes et les normes par lesquelles chacune demeure. Les Informations Minimum requis pour une Expérience DMET (MIDE) est proposé pour fournir des guidelines pour la pharmacogénomique, les informations et les outils nécessaires pour rendre compte aux bases de données omiques publiques. Pour l'interprétation efficace de données DMET, leur partage, leur interopérabilité, leur reproductibilité et leur rapports, nous proposons MIDE.
Christine Fernandez-Maloigne Laboratoire XLIM – Unité Joint Research (JRU) 7252 du CNRS Université de Poitiers-France
Étude des aspects psycho-visuels de la vision stéréoscopique dans des conditions immersives de visualisation Résumé: Les vidéos « 3D » sont considérées comme l’évolution attendue du cinéma et de la télévision, comparable à l’introduction et la généralisation de la couleur au milieu du siècle dernier. La visualisation stéréoscopique, outre les domaines culturel et ludique, peut également apporter un plus indéniable dans l’aide au diagnostic, médical ou non, l’éducation et la formation, le prototypage virtuel, le contrôle qualité non destructif. Les avancées de l’informatique ces dernières années permettent aujourd’hui de construire et de visualiser des scènes 3D complexes, en temps réel, sur de nombreux systèmes stéréoscopiques et ceci va révolutionner les usages. L’innovation majeure dans la visualisation « 3D » numérique stéréoscopique vient de l’apport de la perception de profondeur générée par l’exploitation du phénomène de stéréopsie. Ce phénomène correspond à la perception de la profondeur relative à l’écran de deux stimuli présentés dans le champ visuel de l’observateur, sur deux axes visuels ; cependant, la stéréopsie est restée encore peu étudiée en ce qui concerne les contenus « 3D » visualisés sur des moyens techniques donnant l’illusion de la 3e dimension. Les études actuellement réalisées montrent que la stéréopsie induite par la visualisation « 3D » peut entrainer un certain inconfort visuel qui n’est ni quantifié ni modélisé à ce jour. Dans le cadre d’une étude pour un partenaire industriel, nous avons comparé un système de projection de type cinéma 3D « classique », grand écran avec lunettes actives, avec un système de projection stéréoscopique immersif, interactif et multi-utilisateurs permettant des simulations informatiques de type réalité virtuelle. Ce système est constitué d’un écran 360° entourant entièrement les spectateurs et diffusant un univers constitué d’images numériques calculées en temps réel, affichées via une projection stéréoscopique, et visualisables par des lunettes actives. Il exploite une diffusion sonore spatialisée et une interactivité multi-utilisateurs intuitive en utilisant la captation des gestes dans l’espace. Nous présenterons une étude subjective en vue de quantifier la qualité de rendu des 2 systèmes en termes de sentiment d’immersion et de confort visuel.
Laboratoire CRIStAL UMR CNRS 8219 Télécom-Lille France
Problèmes à la modélisation par la géométrie riemannienne Résumé: Dans la vision par ordinateur, les formes ont été représentées dans de nombreuses façons différentes: les nuages de points, les surfaces, les images ou le squelette ne sont que quelques exemples. La difficulté provient de la non-linéarité de ces espaces de forme. En effet, ces espaces de forme ne sont pas euclidienne et on ne peut pas effectuer des statistiques classiques avec. Une façon de surmonter cette difficulté est d'introduire une structure riemannienne sur l'espace des formes. Cela nous permet d'exploiter la géométrie de ces espaces de forme et de développer des outils statistiques efficaces. Dans cet exposé, je vais montrer quelques travaux récents de notre groupe sur la géométrie de Riemann et son application dans une variété de problèmes, y compris la reconnaissance des visages, des expressions et des actions.
Conférencier 4
Tuan D. Pham Département de génie biomédical Université de Linköping, Suède
Classification des textures et visualisation des données biomédicales Résumé: Cette intervention présentera les développements récents dans la classification des textures et la visualisation des images et des signaux biomédicaux, y compris les données physiologiques, microscopiques, IRM et CT. Les méthodes techniques impliquent le chaos, la dynamique non linéaire, la géostatistique, la logique floue et le deep learning. Les résultats de benchmark actuels et certains défis de la recherche future en big data en médecine personnalisée sont également abordés avec des orientations suggérées.
Conférencier 5
Ikram El khadji SAP Maroc
Analyse des données et aperçu de la recherche Résumé: Le domaine de la bioinformatique peut être simplifié "comme le domaine scientifique qui traite des données et des connaissances : le stockage, la récupération et l'utilisation optimale pour la résolution de problèmes et la prise de décision dans le domaine de l'analyse des données biologiques. Le domaine de la bioinformatique a vu une augmentation considérable de la recherche émergente, menant à de nouveaux défis dans la gestion et l'analyse de toutes ces nouvelles données. Lorsque nous observons les résultats de la révolution informatique dans le domaine de la bioinformatique, nous pouvons apprécier le fait que beaucoup de déductions critiques concernant notre compréhension de la santé et les agents causants, sont venus à l'avant. Les défis sur le terrain sont principalement la vaste gamme de données, l'évolution des connaissances qui est le résultat de l'étude du génome et sa manifestation. Cette présentation fournira quelques idées pour l'analyse à l'appui de la recherche et les méthodes pour gagner la visibilité interfonctionnelle et des aperçus collectifs sur la qualité de la recherche axée sur les données. Analyser de façon interactive et collaborative de grands volumes de données de recherche bioinformatique de diverses sources afin de favoriser la personnalisation des solutions médicales. Au cours de l'exposé, les dernières tendances technologiques en matière d'analyse seront partagées, afin de soutenir les chercheurs qui ont besoin de la capacité de transformer un volume important de données provenant de diverses sources en informations pratiques. Diverses études de cas seront partagées au cours de la présentation pour présenter les développements de pointe.
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